Dois anos se passaram desde o ataque do CCG em Anteiku. Embora a atmosfera em Tóquio tenha mudado drasticamente devido ao aumento da influência do CCG, os ghouls continuam a representar um problema, pois começaram a tomar cuidado, especialmente a organização terrorista Aogiri Tree, que reconhece a crescente ameaça do CCG à sua existência. A criação de uma equipe especial, conhecida como Esquadrão Quinx, pode fornecer ao CCG o impulso necessário para exterminar os residentes indesejados de Tóquio.
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