Deep Space Nine é mais sombrio e contém níveis mais elevados de intensidade emocional e drama do que outros programas de Star Trek. Mas nunca chega ao ponto de ser severo. Ainda é muito alegre quando comparado a programas mais assustadores.
A história envolve perifericamente: opressão racial, escravidão, genocídio, internamento e campos de concentração, guetos (enganosamente chamados de "santuários") com humanos, agentes secretos e espiões, interrogatórios, crime organizado, suicídio, terrorismo, armas de destruição em massa, posse por forças sobrenaturais (boas e más), doença mental, adoração a demônios, culto suicida, golpe de Estado tentado por um oficial militar humano, traição e roubo cometidos por vários oficiais militares humanos desertores.
Uma cena de tortura (ver seção de violência). A música de fundo amplia o efeito psicológico.
A série apresenta uma espécie de metamorfo malévolo que tem a habilidade de duplicar pessoas e objetos de forma indistinta. Pode ser assustador para crianças mais novas.
Muitas espécies exóticas aparecem na série, algumas delas (como os Letheans ou os Jem'Hadar) podem ser assustadoras para crianças mais novas.
Os episódios "... Nem a Batalha do Forte" (5x04) e "O Cerco de AR-558" (7x08) são histórias de guerra "nas trincheiras" que podem ser muito intensas / realistas / sombrias para crianças mais novas . O último envolve um menino que perde permanentemente uma perna como resultado de um ferimento de guerra.
O episódio "Vozes distantes" (3x18) pode ser particularmente assustador para crianças mais novas.
O episódio "Hard Time" (4x19) contém alta tensão emocional, envolve confinamento, fome, assassinato, disfuncionalidade familiar / social e intenção suicida.
Existem alguns outros episódios - como "The Visitor" (4x03), "The Begotten" (5x12), "Dr. Bashir, presumo?" (5x16) ou "Órfão do Tempo" (6x24) - que são emocionalmente intensos.