Ao contrário de muitos programas infantis da época, Mister Rogers ocasionalmente tratava de temas difíceis como Guerra, Violência, Morte e até Divórcio. No entanto, é tudo educativo e destinado a ajudar as crianças a entender que essas coisas acontecem na vida, mas desde que cuidemos uns dos outros e ajudemos todos a entender que são cuidados, podemos superar os tempos difíceis.
Mister Rogers ocasionalmente canta uma música chamada "What Do You Do With The Mad That You Feel?" Ele às vezes canta com uma voz severa, mas não é para assustar ou intimidar, é para ajudar as crianças a pensar em maneiras de lidar com a raiva e os sentimentos de raiva, sem ferir ninguém.
Em um episódio, um dos peixes do Sr. Rogers morre, nós o vemos sem vida em uma toalha de papel. Isso pode ser perturbador para alguns espectadores.
Fala sobre divórcio, morte, tensões entre raças, ameaça de guerra etc.