Quando King Kong caiu para sua morte trágica do Empire State Building, havia uma jovem cientista Dra. Lorna Jenkins que o clonou e o levou de volta à Ilha Kong para que ele pudesse finalmente ser protegido novamente do mundo. Dezoito anos depois, seu neto Jason e seu amigo Tan trazem seu professor para a ilha para mostrar a ele o paraíso e, claro, Kong. Mas seu professor Ramon De La Porta tem outros planos, ele rouba as Pedras Primordiais da ilha que controlam o equilíbrio da ilha e garantem que o deus aprisionado Chyros não escape. Então, agora, para restaurar o equilíbrio da ilha, Jason, Tan, uma garota xamã chamada Lua e, claro, Kong, devem viajar ao redor do mundo para recuperar as pedras e parar De La Porta de uma vez por todas.
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