O personagem principal Michele (Ludovico Girardello), que tem 16 anos, descobre seu lado escuro e sua habilidade de ser malvado. O encontro entre Michele, sua mãe biológica, Yelena (Ksenia Rappoport) e a misteriosa Natasha (Galatea Bellugi) vão revirar a existência do menino. Novos personagens - os super-heróis chamados de "especiais" - são apresentados no segundo capítulo de The Invisible Boy: Cinetica (Katia Mironova), Roccia (Mikolai Chroboczeck), Morfeo (Dario Cantarelli), que se juntam com Yelena e Natasha para se vingar seu inimigo comum Igor Zavarov (Kristof Konrad), um implacável magnata russo que prendeu os super-heróis para capturar o segredo de seus poderes especiais.
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