A história se passa em um período alternado do pós-guerra, em 1996, onde o Japão está dividido. Hokkaido é governado pela "União", enquanto Honshu e outras ilhas do sul estão sob a autoridade dos EUA. Uma torre alta foi construída em Hokkaido, que até podia ser vista de Tóquio. No verão de 1996, três estudantes do ensino médio prometem atravessar a fronteira com um avião construído e desvendar o segredo da torre, mas o projeto foi abandonado depois que a garota Sayuri Sawatari ficou misteriosamente doente e foi transferida. para Tóquio. Anos mais tarde, à beira de outra guerra, Hiroki Fujisawa descobre que Sayuri estava em coma desde então e pede a Takuya Shirakawa para ajudá-lo a encontrar uma maneira de acordá-la.
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