Lily-Rose Depp nasceu em 27 de maio de 1999 em Paris, França. Sua mãe é a cantora francesa Vanessa Paradis, e seu pai é o ator americano Johnny Depp. O irmão mais novo, John "Jack" Christoper III, juntou-se ao clã em 2002. Durante os primeiros anos de Lily-Rose, a família Depp-Paradis dividiu o tempo entre as suas casas em França e em Los Angeles. Eles estavam trabalhando.
Depp e Paradis se separaram em 2012 depois de 14 anos juntos. Após a separação, tanto Lily-Rose e Jack passaram a maior parte do seu tempo stateside onde frequentaram escolas privadas de prestígio em Los Angeles.
Na escola, Lily-Rose tem um bom desempenho acadêmico. Ela participou da equipe de debate e também participou de apresentações de dança e música. Ela é bem apreciada por seus professores e colegas e é dito ter um sentido de humor seco, um pouco escuro. Ela é elogiada por aqueles próximos a ela como sendo extremamente brilhante, engraçado e kindhearted. Além de atuar, ela também se interessou pela gravação; A faixa "La Ballade De Lily Rose" aparece no álbum de Paradis "Bliss" (2000.)