Jonny (às vezes creditado como Johnny) Lee Miller nasceu em 15 de novembro de 1972, em Kingston, Inglaterra, Reino Unido. Ele é filho dos atores Anna Lee e Alan Miller e neto do ator Bernard Lee. Depois de aparecer em muitas peças do ensino médio em sua seletiva escola de gramática estadual, Jonny largou os estudos aos 17 anos para seguir carreira de ator em tempo integral. Embora ele tenha sido tímido e quieto no colégio, ele certamente se expressa bem em todos os seus filmes. Seu primeiro filme popular foi Hackers (1995), ao lado de Angelina Jolie e Matthew Lillard. Mais tarde, sua co-estrela Angelina se tornou sua esposa. Eles se divorciaram três anos depois. O fato interessante é que toda a sua família gosta de atuar, desde seus avós. Ele tem uma parceria na produtora Natural Nylon, que também inclui Jude Law e Ewan McGregor, seu co-star em Trainspotting (1996).