Edward Walter Furlong nasceu em Glendale, Califórnia. Sua mãe, Eleanor (Tafoya), é de família mexicana e trabalhava em um centro juvenil. Furlong não tinha ambições de atuar até ser abordado pelo agente de elenco Mali Finn, que procurava um jovem ator para interpretar o papel de John Connor no que se tornou um dos maiores sucessos de bilheteria dos anos 1990, Terminator 2 : Dia do Julgamento (1991). Finn imediatamente reconheceu sua habilidade e o sugeriu para o papel, sentindo que ele poderia se manter tocando ao lado de Arnold Schwarzenegger e Linda Hamilton.
Por seu papel no início da carreira, Furlong ganhou um prêmio de filme da MTV de melhor papel revelação e um prêmio Saturn Sci-Fi de melhor jovem ator. A partir daí, ele percorreu um caminho pouco convencional por Hollywood, o que o levou a trabalhar com algumas das principais pessoas do ramo, em estúdios e filmes independentes. Seu trabalho incluiu estrelar ao lado de Jeff Bridges em American Heart (1992), pelo qual foi indicado ao prêmio IFP Spirit de melhor ator coadjuvante. Ele também estrelou em A Home of Our Own (1993) com Kathy Bates, Little Odessa (1994) com Tim Roth, The Grass Harp (1995) com Walter Matthau e Barbet Schroeder's Before and After (1996).
Ele também estrelou ao lado de Edward Norton no polêmico e emocionante drama de Tony Kaye American History X (1998) e na comédia de sucesso Pecker (1998). Mais recentemente, Furlong contracenou com Willem Dafoe no drama de prisão Animal Factory (2000), dirigido por Steve Buscemi. Recentemente, ele estrelou o conto do século 13 de Pupi Avati, The Knights of the Quest (2001).