Nascido em Danbury, Connecticut, EUA, filho de Greg e Mary, Jonathan Brandis iniciou sua carreira aos 5 anos, atuando em vários comerciais de televisão. Ele também apareceu em pequenas partes em vários filmes e programas de TV antes de seu primeiro papel no filme de 1990 The NeverEnding Story II: The Next Chapter (1990). Ele estrelou em filmes populares como Ladybugs (1992) e Lucas Wolenczak na série de televisão de Steven Spielberg, SeaQuest 2032 (1993). Ele dobrou seus cursos no ensino médio para poder terminar um ano mais cedo por seu papel no SeaQuest. Depois que sua carreira parou um pouco, ele esperava que seu papel no filme de drama sério Hart's War (2002) a relançasse. No entanto, a maioria de suas cenas acabou sendo cortada do filme final. Isso fez com que ele caísse em uma depressão profunda, na qual beberia pesadamente e tragicamente sua própria vida em 12 de novembro de 2003.