Daniel Gillies nasceu em 14 de março de 1976 em Winnipeg, Canadá e mudou-se para a Nova Zelândia ainda jovem. Embora nascido em uma família de grande formação médica (seu pai é um pediatra, sua mãe uma enfermeira e seu tataravô é o renomado pioneiro em otorrinolaringologia / cirurgia plástica Sir Harold Gillies), ele se interessou por atuação e estudou na Unitec School of Performing Arts. Frustrado com a falta de oportunidades na Nova Zelândia, mudou-se para Sydney, Austrália, por seis semanas em 2001, antes de retornar ao Canadá por dois meses, onde trabalhou como garçom e lavador de pratos até decidir se mudar para Los Angeles, EUA.