Christopher Logan nasceu em Belfast e cresceu na aldeia de Groomsport em County Down, na Irlanda do Norte. Ele foi membro do The National Youth Theatre por vários anos - os papéis do NYT incluíram Michael em 'Dancing at Lughnasa' e Peter Quince em 'A Midsummer Night's Dream'.
Em 2000, ele começou a treinar na Academia Real de Arte Dramática (RADA) em Londres ao lado de Sinead Matthews, Ben Whishaw, Jonas Armstrong e Chipo Chung, e se formou em 2003. A produção de Kathy Burke de 'The Quare Fellow' para a Oxford Stage Company marcou sua estréia teatral profissional.
A irmã de Christopher, Molly Logan, se formou na RADA em julho de 2012.