Entre seus papéis mais conhecidos, Johnson retrata o mutante taxista Benny no filme de ficção científica de 1990, Total Recall. Ele também estrelou o musical da Broadway, No Século XX e apareceu no "Shakespeare in the Park" do Teatro Público de 2005 revival de Dois Cavalheiros de Verona. Ele também estava no musical The Rink.
Johnson também é bem conhecido pelos fãs de Star Trek por interpretar Broca, o cardassiano que se torna líder da União Cardassiana em Star Trek: os dois últimos episódios de Deep Space Nine, "The Dogs of War" e "What You Leave Behind". Johnson também foi convidado em The Munsters Today, The Fresh Prince de Bel-Air e The Practice. Seus outros créditos cinematográficos incluem Off the Mark, American Blue Note, Murder By Numbers, Hideous !, Archibald, o Rainbow Painter e Shadow of the Cobra.
Os créditos de Johnson como produtor incluem Ragdoll, The Horrible Dr. Bones e The Vault.
