Marguerite MacIntyre recebeu seu BFA da University of Southern California, e subsequentemente treinou na Royal Academy of Dramatic Arts em Londres.
Ela trabalhou dentro e fora da Broadway, regionalmente e na televisão e cinema. Ela fez sua estréia na Broadway como Avril / Mallory em "City of Angels", dirigido por Michael Blakemore. Seus créditos favoritos em Nova York incluem os papéis de: Bertha Mason / Scatcherd em "Jane Eyre", dirigido por John Caird; Sarah Stone na adaptação de "No Way To Treat A Lady", de William Goldman, dirigido por Scott Schwartz; Delphi em Alan Weird "Weird Romance"; e Grace Farrell em "Annie Warbucks", dirigido por Martin Charnin.
Ela estrelou regionalmente no Papermill Playhouse, no La Jolla Playhouse, no Barrington Stage, no Edinburgh Fringe Festival, no Scottsdale Center for the Arts e no Godspeed Opera House. Em Los Angeles, ela se apresentou no Pantages, no Matrix Theater de Joe Stern, no Falcoln Theatre de Garry Marshall, e duas vezes na Reprise Series no Freud Playhouse, incluindo sua terceira vez trabalhando com o ídolo Larry Gelbart. Ela fez cinco gravações originais e recebeu um prêmio da Dramalogue.
Marguerite fez sua estréia na televisão no horário nobre como convidada na abertura da sexta temporada de Seinfeld (1989) como a sitiada Miss Rhode Island. Desde então, ela estrelou Bones (2005), The Mentalist (2008), CSI: Miami (2002), CSI: NY (2004) e muitos outros. Ela voltou mais memorável ao lado de Michael Chiklis em The Shield (2002). Ela foi a série regular Abby Day no drama de John Scott Shepherd, The Days (2004) para a ABC, seguido por três temporadas estrelando como Nicole Trager no drama de ficção científica da ABC Family, Kyle XY (2006). Mais recentemente, ela sobreviveu a três temporadas como Sherriff Liz Forbes no sucesso da CW, The Vampire Diaries (2009).
Em 2011, Marguerite foi contratada pelo Tornante de Michael Eisner para escrever uma série de vinte peças, Pretty Tough (2011), adaptada do romance de Liz Tigelaar, produzido pela Vuguru Media e dirigido por Stewart Hendler.
Ela recentemente fechou um contrato para escrever um filme, @emma, para a Darko Entertainment, e produzido pela criadora de "The Vampire Diaries", Julie Plec.