Depois de começar na Toho em 1942, a carreira de Matsubayashi, como a de tantos outros, foi estagnada pela Segunda Guerra Mundial. Depois de servir na Marinha Imperial, à qual foi ferozmente leal, Matsubayashi retornou à indústria através do estúdio Shintoho em 1946. Shintoho lhe deu seu primeiro emprego de diretor, Tokyo Dimples, em 1952. Depois de retornar a Toho em 1955, Matsubayashi se especializou em comédias de assalariados, como a série Shacho (Boss). Ele dirigiu mais dessa série (23 entradas) do que qualquer outro cineasta. Devido ao patriotismo do tempo de guerra de Matsubayashi, maior do que o de muitos de seus contemporâneos, Toho frequentemente confiava a ele seus filmes de guerra de grande orçamento e repletos de efeitos especiais dos anos 1960 até o início dos anos 1980. Seu filme mais conhecido fora do Japão é provavelmente Sekai Daisenso (também conhecido como A Última Guerra, 1961).