Cory McAbee nasceu no norte da Califórnia. Ele passou os primeiros 12 anos de sua vida adulta trabalhando como chefe da segurança em bares e casas noturnas em São Francisco. Foi durante este período que se envolveu com o teatro. Suas primeiras apresentações no palco incluíram o papel de Pôncio Pilatos em Jesus Cristo Superstar.
De 1989 a 2011, McAbee foi o cantor / compositor do grupo musical The Billy Nayer Show. Seu primeiro filme foi o curta musical animado pintado à mão, Billy Nayer (1992). Ele estreou no Festival de Cinema de Sundance de 1992. Em 1995, McAbee voltou ao Festival de Cinema de Sundance com uma apresentação musical ao vivo de seus primeiros curtas-metragens. Foi chamado, The Billy Nayer Chronicles. Foi o primeiro evento multimídia a ser apresentado no Sundance.
Após uma turnê pelos Estados Unidos do Billy Nayer Chronicles, McAbee ficou sem-teto por três anos. Foi nesse período que escreveu o roteiro de seu primeiro longa-metragem, The American Astronaut (2001). O roteiro foi aceito no laboratório de roteiristas de Sundance. Em 2000, o filme foi financiado e produzido com McAbee como escritor, diretor, compositor e ator principal. The American Astronaut (2001) ganhou vários prêmios e continua a se apresentar em teatros, festivais e universidades em todo o mundo.
Após o lançamento de The American Astronaut (2001), McAbee viajou pelo mundo com The Billy Nayer Show enquanto continuava a escrever roteiros. Em 2003, ele se apresentou no NYC Lincoln Center e no Guggenheim Museum como músico da ópera chinesa The Orphan of Zhao.
Em 2007, Cory McAbee foi contratado pelo Festival de Cinema de Sundance e pela GSM Association para criar um curta-metragem para as tecnologias emergentes de distribuição de filmes para telefones celulares. Após essa experiência, McAbee começou a trabalhar em formas alternativas de autodistribuição. Em 2009, criou o longa-metragem episódico Stingray Sam (2009). O filme foi escrito e projetado para telas de todos os tamanhos e estreou no Festival de Cinema de Sundance de 2009 como parte do Programa New Frontier.
Como cineasta e por seu trabalho em formas alternativas de autodistribuição, Cory McAbee ministrou Masters Classes e deu palestras em universidades e simpósios em todo o mundo. Em 2010, McAbee escreveu e dirigiu um longa-metragem sem orçamento intitulado Crazy and Thief (2012), que foi lançado em festivais ao redor do mundo em 2012.
Em 2012, McAbee fundou a colaboração internacional de artes, Captain Ahab's Motorcycle Club, com o objetivo de criar solidariedade internacional entre artistas por meio da criação de um longa-metragem gerado globalmente. O filme se chama Deep Astronomy and the Romantic Sciences (2021). De 2012 a 2017, a McAbee realizou concertos em apoio a este projeto nos Estados Unidos, Europa e Austrália. Em 2015 McAbee gravou e produziu seu primeiro álbum solo, Small Star Seminar, que se tornou um catalisador para a narrativa do filme. Em 2017, McAbee desenvolveu uma performance ao vivo intitulada Deep Astronomy and the Romantic Sciences. Essas performances foram criadas com o propósito de entretenimento ao vivo e como eventos a serem documentados por colaboradores para uso neste longa-metragem, e estreados no Festival de Cinema de Sundance de 2018. Deep Astronomy and the Romantic Sciences (2021) deve ser concluído em 2018 para o lançamento do festival em 2019.
Cory McAbee mora em Nova York.