Nascido em Tânger, em 1961, em uma família de exilados anarquistas espanhóis, ele foi clandestinamente invadido pela Suíça por seus pais em 1963, quando ingressaram como trabalhadores sazonais. No início dos anos 80, ele e seus amigos fundaram o Le Cabaret Orwell, uma meca da cultura underground no oeste da Suíça, seguida pelo internacionalmente famoso local de rock La Dolce Vita. Após uma exibição de filmes experimentais, ele se tornou um produtor e diretor de cinema independente autodidata. Ele criou filmes experimentais e segmentos de televisão iconoclastas em 1983. Em 1985, ele se juntou à produtora Climage, com quem permaneceu um fiel colaborador, e produziu mais de vinte documentários bem conceituados sobre assuntos de imigração e identidade. Ele foi o editor dos filmes de Jacqueline Veuve, cujo Le Journal de Rivesaltes foi premiado com o Swiss Film Award em 1998. Seu documentário Exit - o direito de morrer recebeu vários prêmios internacionais, incluindo o prestigiado prêmio Golden Link UER pela melhor co-produção européia e também o Swiss Cinema Award em 2006. Em 2008, seu documentário The Fortress ganhou o Leopardo de Ouro no Festival de Locarno, bem como muitos outros prêmios internacionais. Seu filme Special Flight, filmado em 2011 em um centro de detenção administrativa, recebeu mais de trinta prêmios internacionais, incluindo o Swiss Film Award e o Prix Europa. Em seu acompanhamento de 2013 O mundo é assim, Fernand Melgar conta a história de alguns dos protagonistas do Special Flight após sua expulsão da Suíça. Seu último filme, The Shelter, foi filmado em um abrigo de emergência para moradores de rua em Lausanne.
