Guillermo del Toro nasceu em 9 de outubro de 1964 em Guadalajara, Jalisco, México. Criado por sua avó católica, del Toro desenvolveu um interesse pelo cinema no início da adolescência. Mais tarde, ele aprendeu sobre maquiagem e efeitos com o lendário Dick Smith (O Exorcista (1973)) e começou a fazer seus próprios curtas-metragens. Aos 21 anos, del Toro foi produtor executivo de seu primeiro longa, Dona Herlinda e Seu Filho (1985). Del Toro passou quase 10 anos como supervisor de maquiagem e formou sua própria empresa, a Necropia, no início dos anos 1980. Ele também produziu e dirigiu programas de televisão mexicanos nessa época e ensinou cinema.
Del Toro teve sua primeira grande chance quando Cronos (1993) ganhou nove Ariel Awards (o equivalente mexicano do Oscar) e, em seguida, ganhou o Prêmio da Semana Internacional da Crítica em Cannes. Após esse sucesso, del Toro fez seu primeiro filme de Hollywood, Mimic (1997), estrelado por Mira Sorvino.
Del Toro teve algumas experiências infelizes trabalhando com um exigente estúdio de Hollywood em Mimic (1997) e voltou ao México para formar sua própria produtora, The Tequila Gang.
Em seguida, para del Toro, foi The Devil's Backbone (2001), uma história de fantasmas da Guerra Civil Espanhola. O filme foi saudado pela crítica e pelo público, e del Toro decidiu dar uma nova chance a Hollywood. Em 2002, ele dirigiu a sequência de vampiros de Wesley Snipes, Blade II (2002).
Em um rolo, Del Toro seguiu Blade II (2002) com outro filme de sucesso inspirado em quadrinhos, Hellboy (2004), estrelado por um dos atores favoritos de Del Toro, Ron Perlman.
Del Toro é divorciado, tem uma filha e um filho e mora em Los Angeles e Toronto.