Michael Corbett Shannon nasceu e foi criado em Lexington, Kentucky, filho de Geraldine Hine, advogada, e Donald Sutherlin Shannon, professor de contabilidade da DePaul University. Seu avô era o entomologista Raymond Corbett Shannon.
Shannon começou sua carreira profissional em Chicago. Seu primeiro papel foi em "Winterset" no Illinois Theatre Center. Nos anos seguintes, ele continuou trabalhando no palco com empresas como Steppenwolf, The Next Lab e Red Orchid Theatre. Posteriormente, ele se mudou para Londres por um ano, e se apresentou no West End de Londres em produções como "Woyzeck", "Killer Joe" e "Bug".
Enquanto em Chicago, Shannon também se manteve ocupada em frente a câmeras de cinema e televisão, mais notavelmente no projeto de tela grande Chicago Cab (1997), baseado no longa-metragem "Hellcab". Kangaroo Jack (2003) marcou a terceira produção de Jerry Bruckheimer na qual Shannon apareceu. Ele também apareceu em Bad Boys II (2003), dirigido por Michael Bay e estrelado por Will Smith e Martin Lawrence, e em Grand Theft Parsons (2003), com Johnny Knoxville e Christina Applegate.
Além disso, Shannon apareceu em Pearl Harbor (2001), também dirigido por Bay. Seus outros créditos no cinema também incluem 8 Mile, de Curtis Hanson (2002); Cameron Crowe's Vanilla Sky (2001) com Tom Cruise; High Crimes de Carl Franklin (2002) com Morgan Freeman; John Waters, Cecil B. DeMented (2000), e o drama de guerra de Joel Schumacher Tigerland (2000).