Nascido no Sudão, Siddig foi criado na Grã-Bretanha e frequentou a Academia de Música e Artes Dramáticas de Londres (LAMDA), onde estudou atuação e teatro. Imediatamente após deixar o LAMDA, Sid fez uma temporada de teatro em Manchester, além de se apresentar em diversos shows em pubs e pequenos teatros. Mais tarde, Siddig trabalhou como diretor em um pequeno teatro em Londres.
"Eu estava em uma situação em que praticamente tinha uma companhia de teatro à minha disposição e um teatro à minha disposição e podia fazer o que quisesse ... contanto que fizesse de graça. O que é uma espécie de passo antes de cobrar e não ser capaz de fazer o que você gosta. Eu estava em um ponto em que poderia simplesmente continuar e me tornar um diretor em Londres, como estagiário na Royal Shakespeare Company ou algo assim, e acabar sendo um diretor de boa fé. Foi uma grande luta porque por um ano e meio, que é o tempo que passei dirigindo imediatamente depois de deixar a escola de atuação, você simplesmente não tem dinheiro, então está apenas vivendo da previdência e está tentando sobreviver. .. "
Durante esse tempo de luta financeira, Sid recebeu o papel de Emir Feisal em A Dangerous Man: Lawrence After Arabia (1992), a sequência de Lawrence da Arábia (1962). Sid co-estrelou com Ralph Fiennes, que interpretou T. E. Lawrence.
A atuação de Siddig em A Dangerous Man: Lawrence After Arabia (1992) chamou a atenção de Rick Berman, que estava criando a nova série Star Trek: Deep Space Nine (1993). Originalmente trazido para a audição para o papel do Capitão Benjamin Sisko, Berman decidiu que Siddig era muito jovem para o papel e escalou-o como Dr. Julian Bashir. O papel teve que ser ligeiramente reescrito para Siddig, já que a "bíblia" original pedia que um homem hispânico fizesse o papel, chamado Julian Amoros, embora Berman relate que nenhum outro ator foi considerado para o papel.
Durante seu tempo em Star Trek: Deep Space Nine (1993), Siddig e a co-estrela Nana Visitor tiveram um filho (Django) e se casaram em 1997. Eles se divorciaram em 2001, embora continuem amigos.
Depois de uma temporada de sucesso de sete anos na televisão, Siddig começou a trabalhar em filmes, acumulando rapidamente papéis em filmes como Vertical Limit (2000), Reign of Fire (2002), Kingdom of Heaven (2005) e o aclamado Syriana ( 2005). No início de 2005, Siddig voltou aos palcos ao lado de Kim Cattrall na produção do West End de "Whose Life Is It Anyway?" Após uma polêmica participação especial no MI-5 (2002), o papel-título em Hannibal: Rome's Worst Nightmare (2006) em 2006 e um papel recorrente em 24 (2001) em 2007 trouxeram Siddig de volta à telinha.
