Nascido em Nova York e criado em Sunnyside, Queens e depois no condado de Westchester, Benh Zeitlin começou sua carreira como cineasta aos 6 anos de idade, quando ele e um amigo fizeram um filme do Batman. Ele continuou fazendo filmes quando criança antes de frequentar a Wesleyan University, onde se formou em cinema. Após a formatura, Benh passou um verão em Praga trabalhando com um artista de animação de destaque. Voltando aos EUA, ele trabalhou em uma escola particular em Manhattan, ajudando alunos do ensino fundamental a criar curtas-metragens.
