Rainn Wilson vive em Los Angeles com sua esposa, o escritor de ficção Holiday Reinhorn (Big Cats), e seu filho, Walter McKenzie Wilson, que nasceu em 2004. Ele cresceu em Seattle, Washington, mas se formou em New Trier H.S. em Winnetka, Illinois. Depois de participar da Universidade Tufts e da Universidade de Washington, Rainn estudou atuação no programa de pós-graduação da NYU e passou anos fazendo teatro dentro e fora da Broadway, em turnês com a Acting Company e no teatro regional, incluindo The Guthrie e Arena.
Rainn co-criou e dirigiu The New Bozena, uma comédia de esboço e show de palhaços pós-moderno que se apresentou em Nova York e acabou fazendo uma apresentação piloto na Fox TV. Ele fez sua estréia na direção com The New Bozena (2005), um curta-metragem baseado no show.
Depois de muitos anos de trabalho na TV e no cinema, seu papel inovador aconteceu, como Arthur, o interesse amoroso estranho para a muito mais antiga Frances Conroy em Six Feet Under (2001). Seu papel favorito até o momento, no entanto, é Bill Harris no filme, Baadasssss! (2003).
Rainn é um membro da Fé Bahá'í.
