Jon Bernthal nasceu e foi criado em Washington D.C., filho de Joan (Marx) e Eric Bernthal, advogado. Seu avô era músico Murray Bernthal. Jon foi estudar na Escola de Teatro de Arte de Moscou, em Moscou, na Rússia, onde também jogou beisebol profissional na federação profissional de beisebol da Europa. Enquanto em Moscou, ele foi notado pelo diretor do Instituto de Treinamento Avançado de Teatro da Universidade de Harvard no American Repertory Theatre e foi convidado para obter seu M.F.A lá. Depois de se formar em 2002, ele já se apresentou em mais de 30 peças regionais e off-Broadway, incluindo muitos com sua própria empresa de teatro premiada Fovea Floods. Ele agora vive em Venice, Califórnia, com seu cachorro, Boss.
