Hannah Waddingham nasceu em 1974, em Wandsworth, Londres. Sua família estava envolvida com artes cênicas como sua mãe, Melodie Kelly, e seus avós maternos eram cantores de ópera.
Ela é mais conhecida por sua contribuição para o teatro musical do West End, particularmente suas performances na produção original de Londres de "Spamalot" como a Dama do Lago e como Desiree Armfelt no aclamado revival de Trevor Nunn de "A Little Night Music", papéis que ganhou duas indicações ao prêmio Olivier.
Em outubro de 2000, ela lançou o single "Our Kind of Love", anunciado simplesmente como Hannah, no UK Singles Chart, onde alcançou a 41ª posição.
Em 2008, ela fez sua estréia no cinema como Elizabeth Maddox em How to Lose Friends & Alienate People (2008). Seus outros créditos em filmes incluem Into the Woods (2011), Les Misérables (2012), Winter Ridge (2018) e The Hustle (2019).
Em 2015, Waddingham se juntou ao elenco da quinta temporada da série Game of Thrones (2011) da HBO como Septa Unella. Hannah apareceu em Sex Education (2019) como Sofia Marchetti. Em 2020, ela ganhou reconhecimento internacional por seu aclamado retrato de Rebecca Welton na série de comédia Apple + Ted Lasso (2020), pela qual ganhou o prêmio de Melhor Atriz Coadjuvante em Série de Comédia no 2021 Critics Choice Awards.
Por cerca de uma década ela está com seu parceiro, Gianluca Cugnetto. Em 2014, o casal deu as boas-vindas ao primeiro filho.